中國農業科學院深圳農業基因組研究所（簡稱"基因組所"）成立于2014年，由農業農村部、中國農業科學院和深圳市政府共同支持建設。基因組所通過整合生物學和大數據科學，來認識與利用農業生物基因組，服務全球農業生產。為此，基因組所成立了組學技術、合成生物學、植物基因組、動物基因組、生態基因組、食品科學等研究中心和相關技術平臺。基因組所的長期愿景是致力于通過顛覆性創新來促進全球農業可持續發展，服務于個性化食品供給體系，并提升人類健康水平和農民社會地位！

成立以來，基因組所深入貫徹落實習近平總書記"四個面向、兩個一流"指示精神，開展科研自主權改革試點工作，被列為中國農科院現代院所改革的"試驗田"，建立了由中國農科院與深圳市主管領導任共同理事長的理事會；組建了近800人的研究隊伍；形成了以組學技術為核心、輻射農業、食品和生態方向的學科體系，獲批"嶺南現代農業科學與技術廣東省實驗室深圳分中心""農業農村部農業基因數據分析重點實驗室"等創新載體；在包括 Science、Nature、Cell 等頂級期刊在內的雜志上發表SCI論文400多篇，以基因組設計育種育成國審、省審新品種30余個，農業基因組學等研究領域占據世界前沿。2019年、2020年連續兩年自然指數排名全國農業類科研院所第一名，多項成果入選"'十三五'農業科技十大標志性成果""中國生命科學十大進展""中國農業科學十大進展"。先后獲得"何梁何利基金"獎、"周光召基礎科學獎""深圳經濟特區建立40周年創新創業和先進模范人物""深圳市市長獎"等獎勵。

目前，基因組所聯合深圳市相關部門提出了"深圳國際食品谷"，規劃已得到市政府印發，將構建農業食品產學研協作生態，做出科技推動農業食品產業轉型升級的先行示范