筑康醫藥2000年創立于南京，2004年更名成立第一家以“筑康”命名的公司（南京筑康藥房連鎖有限公司），2011年喬遷至西善橋醫藥產業工業園區，并組建南京筑康醫藥產業集團。2018年集團進行了股份制改造，搭建了母子公司制的組織架構。控股母公司為江蘇筑康醫藥科技股份有限公司，旗下包括南京筑康醫藥有限公司、江蘇筑康藥房連鎖有限公司、南京筑康潤民藥房連鎖有限公司、南京筑康醫院管理咨詢有限公司、南京寧仁堂生物科技有限公司等5個子公司，以及南京筑康藥房電子商務中心、話務運營中心、中藥代煎代配加工服務中心。