廣州市水務科學研究院有限公司由廣州市水務科學研究所轉企改制而成，于1978年4月成立，原為廣州市水利科學研究所。2022年8月份完成廣州市水務科學研究院有限公司注冊，現為廣州市水務投資集團有限公司全資子公司。

廣州市水務科學研究院有限公司主營項目為研究和試驗發展。經營范圍包括工程和技術研究和試驗發展，技術服務、技術開發技術咨詢。技術交流、技術轉讓、技術推廣，建設工程質量檢測，水利工程質量檢測測繪服務，水文服務，水資源管理，水環境污染防治服務，水污染治理，信息技術咨詢服務，智能水務系統開發，環境保護監觀，環保咨詢服務，檢驗檢測服務，安全評價業務，水利相關咨詢服務，建設工程勘察，防洪除澇設施管理，市政設施管理。

擁有水利工程質量檢測(巖土工程、混凝土工程、機械電氣、金屬結構、量測) 甲級、建設工程質量檢測機構資質、廣東省檢驗檢測機構資質認定、實驗室認(CNAS)、ISO體系認證、廣東省小型水利工程安全評價、廣東省環境污染治理資格行業認定證書、水文、水資源調查評價單位水平評價證書、工程咨詢單位乙級資信證書、測繪資質乙級證書、生產建設項目水士保持監測和方案編制單位水平評價證書等25項資質。

廣州市水務科學研究院有限公司是廣州市唯一一家同時具有水利工程質量檢測機構資質五個甲級和建設工程質量檢測機構資質的檢測單位，首家“全國水利文明單位”;兩次獲得廣東省人民政府科技進步獎二等獎。